Юрий Федорович Дрыгин
заведующий лабораторией, доктор химических наук
Область интересов. Состав лаборатории 2008 г. Область исследований.
Приглашение к сотрудничеству. Адреса и телефоны
Область интересов:
Химия и биохимия нуклеиновых кислот и нуклеопротеидов, Молекулярная биология, Молекулярная вирусология, Молекулярная диагностика вирусных инфекций растений и животных, Электронная и атомно-силовая микроскопия нуклеиновых кислот и нуклеопротеидов.
Состав лаборатории 2008 г.:
Елена С. Гаврюшина – инженер, аспирант 3-го года,
Анна Д. Сушко – соискатель;
Евгения Вахитова – дипломница
Химия и биохимия нуклеиновых кислот и нуклеопротеидов, Молекулярная биология, Молекулярная вирусология, Молекулярная диагностика вирусных инфекций растений и животных, Электронная и атомно-силовая микроскопия нуклеиновых кислот и нуклеопротеидов.
Состав лаборатории 2008 г.:
Елена С. Гаврюшина – инженер, аспирант 3-го года,
Анна Д. Сушко – соискатель;
Евгения Вахитова – дипломница
Область исследований:
Проект: «Изучение природных ковалентных соединений нуклеиновых кислот и белков».
Главная тема исследований – это выделение, структурный и функциональный анализ вирусных и клеточных ковалентных соединений нуклеиновых кислот и белков. Полученные результаты представлены в обзоре (см. также список ссылок):
Yu.F.Drygin "Natural covalent complexes of nucleic acids and proteins: some comments on practice and theory on the path from well-known complexes to new ones" Nucl. Acids Res. v.26, N21, 4791-4796 (1998).
В рамках этого проекта находится исследование механизмов образования и диссоциации природных ковалентных комплексов НК-белок. В частности, мы разработали несколько схем выделения фермента, катализирующего гидролиз фосфодиэфирной связи между РНК пикорнавирусов и концевым белком ВПг (VPg-unlinkase). Результаты исследования этого фермента, его субстратной специфичности опубликованы в нескольких работах:
Ю.Ф. Дрыгин, Е.Ю. Сиянова "Характеристика фермента, гидролизующего природную ковалентную связь между РНК и белком VPg вируса энцефаломиокардита", Биохимия, 51, №2, 249-259 (1986).
Yu.F.Drygin, A.A. Shabanov, A.A.Bogdanov "An enzyme which specifically splits a covalent bond between picornaviral RNA and VPg", FEBS Lett., v. 239, N2, 343-346 (1988).
Viryasov M.B., Yusupova R.A., Shatskaya G.S., Drygin Yu.F. "Purification and study of uridililpolynucleotide-(5'P-->O)-tyrosine phosphoduesterase", Chromatographia, v.45, N1,133-137 (1997).
Р.А Юсупова, А.Ю.Гулевич, Ю.Ф.Дрыгин. «Новый метод выделения фермента, катализирующего гидролиз ковалентной связи между РНК и белком ВПг пикорнавирусов, из клеток асцитной карциномы мышей Кребс II» Биохимия, т. 65, №10, 1440-1449 (2000)..
А.Ю. Гулевич, Р.А. Юсупова, Ю.Ф. Дрыгин «Фосфодиэстераза из клеток асцитной карциномы Кребс 2 специфически гидролизует связь между ВПг и РНК вируса энцефаломиокардита», Биохимия, т.66, №3, 425-430 (2001).
А.Ю. Гулевич, Р.А. Юсупова, Ю.Ф. Дрыгин «Субстратная специфичность фосфодиэстеразы, гидролизующей связь между белком ВПг и РНК пикорнавирусов: минимальная нуклеиновая часть», Биохимия, т.67, №6, 741-749 (2002).
Проект: «Антитела к «узловой структуре» ковалентного соединения РНК-ВПг пикорнавирусов».
Нами были синтезированы модельные соединения, имитирующие «узловую структуру» ковалентного соединения РНК-ВПг пикорнавирусов и на их основе получены антигены и аффинный сорбент для выделения антител. Были получены также антитела к природному комплексу РНК-ВПг вируса энцефаломиокардита. Характеристика специфичности этих антител проводится в настоящее время
А.А.Шабанов, А.А.Калюжный, М.Б.Готтих, Ю.Ф.Дрыгин «Природные субстраты уридилполинуклеотид-(5’P-->O)-тирозин фосфодиэстеразы - фермента, гидролизующего ковалентную связь между РНК и ВПг пикорнавирусов, и их синтетические модели». Биохимия т.61, №6, 1106-1118 (1996).
O. A. Bordunova, O.V. Turina, E.S. Nadezhdina, G.S. Shatskaya, V.P.Veiko, Yu.F. Drygin "ANTIBODIES AGAINST EMC VIRUS RNA-VPg RECOGNIZE Tyr-(5'P'O)-pU AND IMMUNOSTAIN INFECTED CELLS", FEBS Lett., 422, N1, 57-60 (1998).
Иванова О.А., Веньяминова А.Г., Репкова М.Н., Дрыгин Ю.Ф. “СИНТЕЗ МОДЕЛЬНОГО ФОСФОДИЭФИРНОГО «УЗЛА СВЯЗИ» МЕЖДУ РНК И БЕЛКОМ ВПг ПИКОРНАВИРУСОВ, ПОЛУЧЕНИЕ И ХАРАКТЕРИСТИКА АНТИТЕЛ К МОДЕЛЬНОМУ СОЕДИНЕНИЮ”, Биохимия , т. 70, №9, 1258-1266 (2005).
Перспективы: антитела к вирусным геномам
В ходе этого исследования мы открыли, что антитсыворотки к вирусным нуклеиновым кислотам содержат фракцию антител, специфически узнающих антигенные детерминанты. В настоящее время мы пытаемся идентифицировать специфичные для данной вирусной РНК риботопы.
Проект: «Атомно-силовая микроскопия (АСМ) РНК и рибонуклеопротеидов»
Мы широко используем АСМ для изучения вирусов, рибонуклеопротеидов и однонитевых вирусных РНК. В настоящее время с помощью АСМ проводится совместное с профессором Д. Блаасом ( Prof. D. Blaas (Max F. Perutz Laboratories, Medical University of Vienna, Inst. Med. Biochem., Vienna, Austria) исследование механизма выхода вирусной РНК из вириона при инфекции.
Drygin Yu.F., Bordunova O. A., Gallyamov M.O., Yaminski I.V."Atomic Force Microscopy examination of Tobacco Mosaic Virus and Virion RNA" FEBS Lett., 425, N2, 217-221 (1998).
Gallyamov M.O., Drygin Yu.F., Yaminski I.V. "Atomic Force Microscopy Visualization of RNA and Ribonucleoproteins of the Tobacco Mosaic Virus", Surface Investigation, v.15, 1127-1134 (2000).
E.V. Dubrovin, Yu.F. Drygin, V.K. Novikov, I.V. Yaminsky "Atomic force microscopy as a tool of inspection of viral infection" Nanomedicine: Nanotechnology, Biology, and Medicine" v.3, N 2, 128-131 (2007).
Проект: «Молекулярная диагностика вирусных инфекций»
Традиционно лаборатория сотрудничает с кафедрой вирусологии МГУ. Совместно нами разработано несколько технологий молекулярной диагностики вироидной и вирусных инфекций растений и животных клеток, а именно: комбинированная технология ДНК-зондов и иммуноферментного анализа (ИФА), комбинированная технология ОТ-ПЦР-ДНК-зондов-ИФА, технология ДНК-чипов (DNA array) и технология иммунохроматографии на тест-полосках для лабораторной диагностики и диагностики в поле вирусных заболеваний картофеля.
Yu.F.Drygin, S.G.Korotaeva, Yu.L.Dorokhov (1992) "Direct DNA polymerase chain reaction for TMV detection in crude cell extracts", FEBS Lett. v.309, N3, p.350-352.
Дрыгин Ю.Ф., Мусин С.М., Кондакова О.А., Савенков Е.И., Соломатин С.В., Можаева К.А., акад. РАСХН Атабеков И.Г. «Молекулярная диагностика зараженности оздоровленных сортообразцов картофеля Российской Федерации вироидом веретеновидности клубней», Доклады РАСХН, т. 6, №1, 24-25 (1996),.
Кондакова О.А. , Дрыгин Ю.Ф. «ДИАГНОСТИКА ВИРОИДНОГО ЗАБОЛЕВАНИЯ КАРТОФЕЛЯ ЗОНДАМИ (диен)Pt-ДНК», БИОТЕХНОЛОГИЯ, т. 4, 83-90 (1999).
Yu.F. Drygin, S.N. Chirkov, O.A. Kondakova, R.A. Zinovkin, P.A. Ivanov, A.N. Blintsov, E.S. Gavryushina, A.V. Zherdev, N.A. Byzova, B. B. Dzantiev, J.G. Atabekov "High-sensitive technologies for molecular diagnostics of potato virus and viroid infections". Potato Production and Innovative Technologies (eds. A.J. Haverkort, B.V. Anisimov), Wageningen Acad.Publishers, 2007, pp.274-285.
A.N. Blintsov, Yu.F. Drygin*, V.G. Grigorenko, I.P. Andreeeva, A.P. Osipov, J.G. Atabekov "Innovative technology of quick diagnostics for plant virus infections by immunochromatography on test-strips", Potato. Russia-2008 (in press).
В процессе выполнения этого проекта для массовой молекулярной диагностики вироидной и вирусных инфекций нами был разработан новый метод выделения РНК из вирусов, бактерий, растений и животных клеток. На метод была подана заявка для международного патентования.
Ю.Ф. Дрыгин, О.А.Кондакова, С.Н.Чирков, Е.С. Гаврюшина, И.Г.Атабеков Заявка МРСТ/Ю.I2007/ООО31О в России и др. на изобретение.
«Применение нетоксичного водорастворимогоагента в качестве средства для диссоциации природных комплексов нуклеиновых кислот и способ выделения РНК». Международная патентная заявка РСТ/Г112ООТ/О00З1О, 8 июня 2007.
Приглашение к сотрудничеству:
Для сотрудничества приглашаются как дипломированные, так и недипломированные высококвалифицированные биологи и химики, заинтересованные в совместной работе.
Студентам: в лаборатории имеется постоянная возможность для выполнения дипломных и диссертационных работ в области молекулярной биологии и биохимии нуклеопротеидов, вирусологии и молекулярной диагностики вирусных инфекций. Совместно с кафедрой вирусологии начата работа, связанная с нанотехнологиями и наномедициной. Предпочтение отдается студентам, проявляющим интерес к экспериментальной работе.
Соискателям: соискатели кандидатской степени должны иметь опыт работы в одной из следующих областей: молекулярной биологии, химии и биохимии нуклеопротеидов, атомно-силовой и электронной микроскопии биологических макромолекул, молекулярной диагностике вирусных инфекций, наномедицине.
Если Вы готовы к совместной работе, свяжитесь, пожалуйста, с Юрием Дрыгиным.
Адреса и телефоны:
e-mail: drygin@belozersky.msu.ru
Тел.: (+7 - 495)939-55-29;
Факс: (+7-495)939-31-81 (для Ю.Ф. Дрыгина)
Проект: «Изучение природных ковалентных соединений нуклеиновых кислот и белков».
Главная тема исследований – это выделение, структурный и функциональный анализ вирусных и клеточных ковалентных соединений нуклеиновых кислот и белков. Полученные результаты представлены в обзоре (см. также список ссылок):
Yu.F.Drygin "Natural covalent complexes of nucleic acids and proteins: some comments on practice and theory on the path from well-known complexes to new ones" Nucl. Acids Res. v.26, N21, 4791-4796 (1998).
В рамках этого проекта находится исследование механизмов образования и диссоциации природных ковалентных комплексов НК-белок. В частности, мы разработали несколько схем выделения фермента, катализирующего гидролиз фосфодиэфирной связи между РНК пикорнавирусов и концевым белком ВПг (VPg-unlinkase). Результаты исследования этого фермента, его субстратной специфичности опубликованы в нескольких работах:
Ю.Ф. Дрыгин, Е.Ю. Сиянова "Характеристика фермента, гидролизующего природную ковалентную связь между РНК и белком VPg вируса энцефаломиокардита", Биохимия, 51, №2, 249-259 (1986).
Yu.F.Drygin, A.A. Shabanov, A.A.Bogdanov "An enzyme which specifically splits a covalent bond between picornaviral RNA and VPg", FEBS Lett., v. 239, N2, 343-346 (1988).
Viryasov M.B., Yusupova R.A., Shatskaya G.S., Drygin Yu.F. "Purification and study of uridililpolynucleotide-(5'P-->O)-tyrosine phosphoduesterase", Chromatographia, v.45, N1,133-137 (1997).
Р.А Юсупова, А.Ю.Гулевич, Ю.Ф.Дрыгин. «Новый метод выделения фермента, катализирующего гидролиз ковалентной связи между РНК и белком ВПг пикорнавирусов, из клеток асцитной карциномы мышей Кребс II» Биохимия, т. 65, №10, 1440-1449 (2000)..
А.Ю. Гулевич, Р.А. Юсупова, Ю.Ф. Дрыгин «Фосфодиэстераза из клеток асцитной карциномы Кребс 2 специфически гидролизует связь между ВПг и РНК вируса энцефаломиокардита», Биохимия, т.66, №3, 425-430 (2001).
А.Ю. Гулевич, Р.А. Юсупова, Ю.Ф. Дрыгин «Субстратная специфичность фосфодиэстеразы, гидролизующей связь между белком ВПг и РНК пикорнавирусов: минимальная нуклеиновая часть», Биохимия, т.67, №6, 741-749 (2002).
Проект: «Антитела к «узловой структуре» ковалентного соединения РНК-ВПг пикорнавирусов».
Нами были синтезированы модельные соединения, имитирующие «узловую структуру» ковалентного соединения РНК-ВПг пикорнавирусов и на их основе получены антигены и аффинный сорбент для выделения антител. Были получены также антитела к природному комплексу РНК-ВПг вируса энцефаломиокардита. Характеристика специфичности этих антител проводится в настоящее время
А.А.Шабанов, А.А.Калюжный, М.Б.Готтих, Ю.Ф.Дрыгин «Природные субстраты уридилполинуклеотид-(5’P-->O)-тирозин фосфодиэстеразы - фермента, гидролизующего ковалентную связь между РНК и ВПг пикорнавирусов, и их синтетические модели». Биохимия т.61, №6, 1106-1118 (1996).
O. A. Bordunova, O.V. Turina, E.S. Nadezhdina, G.S. Shatskaya, V.P.Veiko, Yu.F. Drygin "ANTIBODIES AGAINST EMC VIRUS RNA-VPg RECOGNIZE Tyr-(5'P'O)-pU AND IMMUNOSTAIN INFECTED CELLS", FEBS Lett., 422, N1, 57-60 (1998).
Иванова О.А., Веньяминова А.Г., Репкова М.Н., Дрыгин Ю.Ф. “СИНТЕЗ МОДЕЛЬНОГО ФОСФОДИЭФИРНОГО «УЗЛА СВЯЗИ» МЕЖДУ РНК И БЕЛКОМ ВПг ПИКОРНАВИРУСОВ, ПОЛУЧЕНИЕ И ХАРАКТЕРИСТИКА АНТИТЕЛ К МОДЕЛЬНОМУ СОЕДИНЕНИЮ”, Биохимия , т. 70, №9, 1258-1266 (2005).
Перспективы: антитела к вирусным геномам
В ходе этого исследования мы открыли, что антитсыворотки к вирусным нуклеиновым кислотам содержат фракцию антител, специфически узнающих антигенные детерминанты. В настоящее время мы пытаемся идентифицировать специфичные для данной вирусной РНК риботопы.
Проект: «Атомно-силовая микроскопия (АСМ) РНК и рибонуклеопротеидов»
Мы широко используем АСМ для изучения вирусов, рибонуклеопротеидов и однонитевых вирусных РНК. В настоящее время с помощью АСМ проводится совместное с профессором Д. Блаасом ( Prof. D. Blaas (Max F. Perutz Laboratories, Medical University of Vienna, Inst. Med. Biochem., Vienna, Austria) исследование механизма выхода вирусной РНК из вириона при инфекции.
Drygin Yu.F., Bordunova O. A., Gallyamov M.O., Yaminski I.V."Atomic Force Microscopy examination of Tobacco Mosaic Virus and Virion RNA" FEBS Lett., 425, N2, 217-221 (1998).
Gallyamov M.O., Drygin Yu.F., Yaminski I.V. "Atomic Force Microscopy Visualization of RNA and Ribonucleoproteins of the Tobacco Mosaic Virus", Surface Investigation, v.15, 1127-1134 (2000).
E.V. Dubrovin, Yu.F. Drygin, V.K. Novikov, I.V. Yaminsky "Atomic force microscopy as a tool of inspection of viral infection" Nanomedicine: Nanotechnology, Biology, and Medicine" v.3, N 2, 128-131 (2007).
Проект: «Молекулярная диагностика вирусных инфекций»
Традиционно лаборатория сотрудничает с кафедрой вирусологии МГУ. Совместно нами разработано несколько технологий молекулярной диагностики вироидной и вирусных инфекций растений и животных клеток, а именно: комбинированная технология ДНК-зондов и иммуноферментного анализа (ИФА), комбинированная технология ОТ-ПЦР-ДНК-зондов-ИФА, технология ДНК-чипов (DNA array) и технология иммунохроматографии на тест-полосках для лабораторной диагностики и диагностики в поле вирусных заболеваний картофеля.
Yu.F.Drygin, S.G.Korotaeva, Yu.L.Dorokhov (1992) "Direct DNA polymerase chain reaction for TMV detection in crude cell extracts", FEBS Lett. v.309, N3, p.350-352.
Дрыгин Ю.Ф., Мусин С.М., Кондакова О.А., Савенков Е.И., Соломатин С.В., Можаева К.А., акад. РАСХН Атабеков И.Г. «Молекулярная диагностика зараженности оздоровленных сортообразцов картофеля Российской Федерации вироидом веретеновидности клубней», Доклады РАСХН, т. 6, №1, 24-25 (1996),.
Кондакова О.А. , Дрыгин Ю.Ф. «ДИАГНОСТИКА ВИРОИДНОГО ЗАБОЛЕВАНИЯ КАРТОФЕЛЯ ЗОНДАМИ (диен)Pt-ДНК», БИОТЕХНОЛОГИЯ, т. 4, 83-90 (1999).
Yu.F. Drygin, S.N. Chirkov, O.A. Kondakova, R.A. Zinovkin, P.A. Ivanov, A.N. Blintsov, E.S. Gavryushina, A.V. Zherdev, N.A. Byzova, B. B. Dzantiev, J.G. Atabekov "High-sensitive technologies for molecular diagnostics of potato virus and viroid infections". Potato Production and Innovative Technologies (eds. A.J. Haverkort, B.V. Anisimov), Wageningen Acad.Publishers, 2007, pp.274-285.
A.N. Blintsov, Yu.F. Drygin*, V.G. Grigorenko, I.P. Andreeeva, A.P. Osipov, J.G. Atabekov "Innovative technology of quick diagnostics for plant virus infections by immunochromatography on test-strips", Potato. Russia-2008 (in press).
В процессе выполнения этого проекта для массовой молекулярной диагностики вироидной и вирусных инфекций нами был разработан новый метод выделения РНК из вирусов, бактерий, растений и животных клеток. На метод была подана заявка для международного патентования.
Ю.Ф. Дрыгин, О.А.Кондакова, С.Н.Чирков, Е.С. Гаврюшина, И.Г.Атабеков Заявка МРСТ/Ю.I2007/ООО31О в России и др. на изобретение.
«Применение нетоксичного водорастворимогоагента в качестве средства для диссоциации природных комплексов нуклеиновых кислот и способ выделения РНК». Международная патентная заявка РСТ/Г112ООТ/О00З1О, 8 июня 2007.
Приглашение к сотрудничеству:
Для сотрудничества приглашаются как дипломированные, так и недипломированные высококвалифицированные биологи и химики, заинтересованные в совместной работе.
Студентам: в лаборатории имеется постоянная возможность для выполнения дипломных и диссертационных работ в области молекулярной биологии и биохимии нуклеопротеидов, вирусологии и молекулярной диагностики вирусных инфекций. Совместно с кафедрой вирусологии начата работа, связанная с нанотехнологиями и наномедициной. Предпочтение отдается студентам, проявляющим интерес к экспериментальной работе.
Соискателям: соискатели кандидатской степени должны иметь опыт работы в одной из следующих областей: молекулярной биологии, химии и биохимии нуклеопротеидов, атомно-силовой и электронной микроскопии биологических макромолекул, молекулярной диагностике вирусных инфекций, наномедицине.
Если Вы готовы к совместной работе, свяжитесь, пожалуйста, с Юрием Дрыгиным.
Адреса и телефоны:
e-mail: drygin@belozersky.msu.ru
Тел.: (+7 - 495)939-55-29;
Факс: (+7-495)939-31-81 (для Ю.Ф. Дрыгина)